Современный храм появился уже после того, как были объединены две каменные церкви в центре города. Время постройки – 1647-1650 годы. Денежные средства на возведение были пожертвованы купцами Скрипиными.
Внешне церковь Ильи Пророка представляет собой четырехстолпный храм с колокольней, а также с приделами разного стиля – купольного и шатрового. Внутренние помещения украшают росписи известных местных изографов Савина и Никитина. Первоначально и внешние фасады храма украшали изображения с растительными сюжетами, но за давностью времени они не сохранились.
В XVIII веке, после реконструкции и перепланировки городских кварталов, возле храма была сделана площадь. Позже церковь Ильи Пророка опоясала ажурная ограда, выполненная по проекту А. Павлинова. В 30-е годы XX столетия храм чудесным образом избежал сноса, а уже в конце столетия он был восстановлен и освящен. Сегодня он является музеем, кроме того, в праздничные дни церковного календаря тут совершаются службы.