А начиналось все в 30 -х годах XX века, с крохотного зоосада при краевой технической станции. Под руководством зоолога М. Зверева состав живого уголка пополнялся, велась исследовательская работа.
В годы Великой Отечественной войны в Новосибирск были эвакуированы животные из зоопарков других городов, а также из цирков. Именно на базе этого зверинца в 1947 году было решено создать первый сибирский зоологический парк. Коллекция животных насчитывала в те годы более тридцати видов, птиц - 20 видов.
В 1950 году был организован филиал зоопарка, но надлежащего внимания заведению не уделялось. В 90-х годах было построены новые павильоны, и зоопарк стал принимать большое количество посетителей.
Здесь находится уникальная коллекция кошачьих и куньих видов, при этом сотрудникам зоопарка удалось добиться размножения куньих в неволе.
Эмблема учреждения: снежный барс и перевязка - новый вид млекопитающих, выведенный здесь. Сегодня в зоопарке собрано более 270 видов животных, в том числе и уникальных. Работает дельфинарий, открыт центр океанографии.