Охридское озеро расположилось на территории Албании и Македонии. Показатель его максимальной глубины составляет 178 метров, а средней – 149 метров. Общий размер водосбора равен 2780 кв. км.
Озерное питание обеспечивается преимущественно в восточной части от подземных источников. Также около 30% воды в его глубины поступает от атмосферных осадков и рек.
Озеро Преспа, находящееся вблизи Охридского, «дает» ему около 25% воды. Водные потоки в озеро поступают через подземные карстевые пути. Теряет озеро свои воды по причине испарения (-40%). Также с его глубин берет свое начало река Чёрный Дрин. Движение озерных вод осуществляется против часовой стрелки.
Отличительной особенностью озера является его непосредственный эндемизм. Большую часть пищевой цепочки, как в Танганьике и Байкале, занимают эндемичные виды. В их число входят: фитопланктон, зоопланктон, разнообразные растения, ракообразные, губки, моллюски и планнарии. Также озеру присуще разнообразие видов рыб, начиная от карповых и заканчивая хищными особями. Побережье озера преимущественно болотистое с ровными и пологими грунтами.
