Поначалу на этом месте стояла часовня Святого Креста, упоминания о которой датируются 1510 годом. В 1525 году тут стояла древесная церковь, принадлежавшая кафедре св. Иоанна Крестителя. В 1615 году церковь была перестроена, а 1653 — передана монашескому ордену лазаристов и стала центральным храмом ордена в Польше.
Современное здание было выстроено в 1679—1696 годах в стиле барокко. Его проектировщиком был царский придворный конструктор Йозеф Шимон Беллотто, а основоположниками — аббат Щука и примас Михал Стефан Радзиевский, который освятил церковь 14 октября 1696 года.
Башни, покрытые позднебарочными куполами (1725 - 1737), выполнены Йозефом Фонтана. Фасад (1756) разработан Якубом Фонтана, украшен скульптурами работы Яна Юрия Плерша.
В колоннах храма захоронены урны с сердцами Фридерика Шопена (эпитафия из каррарского мрамора изготовлена в 1880 году Леонардом Маркони) и Владислава Реймонта (1929). В храме также есть эпитафии Болеслава Пруса, Игнация Крашевского, Юлиуша Словацкого и Владислава Сикорского.
В 1-ые дни 2-ой мировой войны храм был разрушен. Были уничтожены также картины «Вечеря Господня» Франциска Смуглевича и «Распятие» Юрия Семигиновского. Во время Варшавского восстания, 6 сентября 1944 года, немцы занесли в святилище два самоходные мины «Голиаф». Взрыв разрушил фасад храма, своды над нижней церковью, Большой алтарь, алтарь св. Роха и св. Винсента де Поля.
Храм был отстроен в 1945 - 1953 годах. С 1965 года при церкви собирается академическое общество «Древо жизни» (Drzewo życia). В 2003 году папа Иоанн Павел II предоставил церкви статус Малой базилики (basilica minor).
Ссылка на источник: http://necrotula.ru/kultovye/bazilika-svyatogo-kresta-varshava
